يمكن ذكر عدة عيوب للذكاء العاطفي، ومن الأهم منها:
1. الإفراط في التعاطف: قد يميل المتحلى بالذكاء العاطفي إلى الإفراط في التعاطف والتشديد على الجانب العاطفي فتصبح نسبة مبالغة في أحيان كثيرة.
2. الانزواء العاطفي: بعض الأفراد يستخدمون أدوات الذكاء العاطفي من أجل الانزواء والابتعاد عن العالم الخارجي وعن العلاقات الاجتماعية، حيث يستخدمون هذه الادوات سرًا لتخفيف الإجهاد أو من أجل تحقيق الانجاز بمفردهم.
3. عدم القدرة على التكيف: في بعض الأحيان، يحدث أن يصعب على المتحلى بالذكاء العاطفي التكيف مع الأشخاص الذين يفتقرون للذكاء العاطفي، مما يؤدي إلى مشاكل تفاهم وتواصل مع الآخرين.
4. الإغراق في العواطف السلبية والاضطرابات النفسية: يمكن لبعض المتحلى بالذكاء العاطفي الانتماء بشدة إلى مجموعات أو إحساس بالاضطهاد، و بالتالي ، يمكن أن يجدوا أنفسهم في دائرة من العواطف السلبية والاضطرابات النفسية التي يصعب عليهم الخروج منها.