يوجد عدة عيوب محتملة للتجارة الحرة، ومن بينها:
1- تهديد للصناعات المحلية: قد يتعرض الصناعيون المحليون لمنافسة قوية من الشركات الأجنبية المنخرطة في التجارة الحرة، مما يمكن أن يؤدي إلى انهيار بعض الصناعات المحلية وفقدان فرص العمل.
2- زيادة العجز التجاري: قد يؤدي انفتاح الأسواق على المنتجات الأجنبية إلى زيادة الاستهلاك للمنتجات المستوردة، مما يؤدي في بعض الأحيان إلى زيادة العجز التجاري.
3- تعزيز الاعتمادية الخارجية: في حالة اعتماد البلد بشكل كبير على الاستيراد، يصبح عرضه للمشاكل الاقتصادية في البلدان المصدرة للسلع ذات الاستيراد.
4- تأثير على السيادة الاقتصادية: في بعض الأحيان، يمكن للدولة أن تفقد القدرة على توجيه اقتصادها واتخاذ القرارات الاقتصادية المستقلة بسبب القيود المفروضة عليها في إطار اتفاقيات التجارة الحرة.
5- تشجيع الانتقال الكافر: قد يؤدي البحث عن العمالة الأرخص في الدول الأخرى إلى نقل بعض الصناعات والوظائف إلى هذه الدول، مما قد يؤثر سلبًا على سوق العمل المحلي.
6- تأثير بيئي: قد يؤدي زيادة النشاط التجاري إلى زيادة استهلاك الموارد الطبيعية وإساءة استخدامها، مما يؤثر على البيئة ويزيد من التلوث والاحتباس الحراري.