من بين عيوب استخدام العملات الرقمية:
1- الاهتمام النسبي القليل بها بالنسبة للعملات الورقية والمعدنية المستخدمة حالياً، ما يجعلها أقل استقراراً وأقل قابلية للاعتمادية.
2- القابلية المحدودة للتداول بها لدى بعض التجار والأسواق، مما يجعلها غير مقبولة في بعض الأماكن.
3- وجود مخاطر متعلقة بأمن البيانات والمعلومات الشخصية، حيث أن التداول بالعملات الرقمية يتطلب استخدام شفرات الحماية والتشفير التي يمكن اختراقها.
4- ارتفاع تكلفة العملات الرقمية في بعض الأحيان نتيجة لارتفاع الطلب عليها، ما يؤدي إلى عدم ملاءمتها للاستخدام في بعض المعاملات الصغيرة.
5- الإمكانيات المحدودة لوجود قانون وإرشادات تنظيمية للعملات الرقمية، مما يجعلها عرضة للتلاعب والغش والاحتيال.