توجد عدة طرق لعزل العسل عند الإنتاج، ومنها:
1- الفصل الطبيعي: حيث يتم ترك العسل ليستقر لمدة تتراوح بين أسبوع وأسبوعين، وذلك ليتم فصل الشوائب والشمع وغيرها من المواد الغير مرغوب فيها.
2- السيفتي: وتعتمد هذه الطريقة على استخدام مصفاة بشكل مخروطي، ويتم تمرير العسل عبرها ويتم فصل الشمع والشوائب بشكل آلي.
3- الترشيح: حيث يتم وضع العسل على قماش ناعم أو على فلتر، ويتم تمرير العسل عبره لفصل الشمع والشوائب.
4- الضغط: ويتم استخدام هذه الطريقة لعصر المصافح والإطارات، ويتم ضغط الإطارات بالترتيب لإخراج العسل وتفصيل الشمع والشوائب.
5- الطرد المركزي: ويتم استخدام الطرد المركزي لفصل الشمع والشوائب عن العسل، حيث يتم وضع العسل في أسطوانة مصغرة في جهاز الطرد، ويتم تحريك الأسطوانة بسرعة عالية لفصل الشمع والشوائب.