تقييم المخاطر الصحية باستخدام الجغرافيا الصحية يتم بعدة طرق منها:
1- تحليل البيانات الجيوجغرافية لتحديد المناطق المعرضة للمخاطر الصحية، مثل الأماكن التي تزيد فيها نسبة الحوادث المرورية أو تلوث الهواء أو تلوث المياه وغيرها.
2- استخدام نظم المعلومات الجغرافية (GIS) لتحليل العوامل المؤثرة على الصحة مثل الارتفاع، الحرارة، الرطوبة، تلوث الهواء، التلوث الصوتي، التلوث الإشعاعي وتوزيع الأمراض في البيئة.
3- دراسة نماذج الانتشار للأمراض باستخدام الجغرافيا الصحية، لتحديد أسباب انتشار الأمراض وتحليل العوامل المؤثرة على هذه الانتشارات.
4- تحديد المخاطر الصحية المحتملة في المستقبل باستخدام نماذج التنبؤ، وذلك بتحليل العوامل الجيوجغرافية المتعلقة بالبيئة والمجتمع والتكنولوجيا.
5- استخدام الجغرافيا الصحية في تخطيط الخدمات الصحية وتحديد المناطق ذات الحاجة العالية للخدمات الصحية والوقاية المثلى من المخاطر الصحية المحتملة.