تستخدم المجمعات الجزيئية في الكيمياء الحيوية والطب لعدة أغراض، منها:
1- تحليل البروتينات: حيث يمكن استخدام المجمعات الجزيئية لفصل البروتينات عن بعضها البعض وتحليلها.
2- الهدف الدوائي: حيث يمكن استخدام المجمعات الجزيئية كهدف دوائي لعلاج الأمراض المختلفة.
3- الكشف عن الأمراض: حيث يمكن استخدام المجمعات الجزيئية للكشف عن الأمراض من خلال تغييرات الجزيئات في الدم أو البول.
4- الدراسات السريرية: حيث يمكن استخدام المجمعات الجزيئية في الدراسات السريرية للتحقق من فعالية العقاقير وأضرارها.
5- تحليل الحمض النووي: حيث يمكن استخدام المجمعات الجزيئية في تحليل الحمض النووي وفصله عن بعضه البعض وتحليله.