توجد العديد من التحديات التي تواجه الإدارة العامة، ومن أهمها:
1- التحول الرقمي والتكنولوجي: حيث يجب على الإدارة العامة الاستعداد للتحول الرقمي والتكنولوجي، والتأكد من أن العاملين لديهم المهارات اللازمة للعمل في بيئة تكنولوجية متطورة.
2- العولمة: حيث يجب على الإدارة العامة فهم تأثير العولمة على الاقتصاد والمجتمع، وتطوير استراتيجيات تتيح للدولة التأقلم مع التغييرات العالمية.
3- الإدارة المالية: حيث تواجه الإدارة العامة تحديات في تحسين إدارة الموارد المالية وتقديم الخدمات بطريقة فعالة وفي نفس الوقت الاحتفاظ بالتوازن المالي.
4- التنمية المستدامة: في الوقت الذي تتطلع فيه الدول إلى تحقيق نمو اقتصادي، يجب أن تتبنى الإدارة العامة توجهاً نحو التنمية المستدامة، وإيجاد طرق لتحقيق التنمية الاجتماعية والاقتصادية والبيئية.
5- التحكيم: يواجه المسؤولون في الإدارة العامة تحديات في التحكيم بين مصالح مختلفة، وضمان التوازن بين تلك المصالح.