1- قلة البيانات: يواجه علماء النفس الصناعي صعوبة في العثور على مجموعات كافية من البيانات المتاحة لتدريب نماذج الذكاء الاصطناعي.
2- التحكم في العوامل البيئية والاجتماعية: يمكن أن تؤثر العوامل البيئية والاجتماعية على تطبيقات الذكاء الاصطناعي المتعلقة بالنفس وبالتالي يجب مراعاتها بعناية.
3- التحكم في الأخطاء التي تقع في جمع البيانات وتحليلها: يمكن أن تؤدي الأخطاء في جمع البيانات وتحليلها إلى نتائج خاطئة تؤثر على دقة النتائج.
4- مشكلة العمومية والتفرد: قد يكون من الصعب تطبيق نفس النموذج الذي يعمل بشكل جيد في واحدة من الحالات على مكان آخر أو في حالة اختلاف السياقات والظروف.
5- قد يتطلب العمل في هذا المجال التعاون مع أخصائيي الطب والنفس على حد سواء ، مما يجعله أكثر تعقيداً.