يواجه المسيحيون في فلسطين العديد من التحديات، بما في ذلك:
1- الحدود الجغرافية: حيث توجد أغلبية المسيحيين في الضفة الغربية والقدس، وتوجد أقلية في قطاع غزة، وهذا يعرضهم للتمييز والانتهاكات والمضايقات من قبل الأقليات الأخرى.
2- التمييز: يعاني المسيحيون من التمييز والعنصرية وعدم المساواة في فرص العمل والتعليم، ويتم استبعادهم في العديد من المجالات الحيوية.
3- الهجرة: يواجه المسيحيون في فلسطين مشكلة الهجرة الصعبة لأنهم يعانوا من سوء المعيشة والظروف الاقتصادية الصعبة.
4- الاضطهاد: قد يعاني المسيحيون في الأراضي الفلسطينية من الاعتداءات والهجمات بشكل مجهول واعتقالات تخص السلطات العسكرية.
5- التصادم السياسي: يشهد المجتمع الفلسطيني على تصادمات كبيرة بين الأطياف السياسية المختلفة، وقد تؤثر هذه التصادمات على المسلمين والمسيحيين على حد سواء.