تشمل النواحي الفسيولوجية لأغوار النفس بعض التغييرات التي تحدث في جسم الإنسان عند تنفيذ تمارين الاسترخاء والتأمل والتنفس، وتشمل:
1- تخفيض ضغط الدم وتنظيمه.
2- تخفيف التوتر العضلي وتحسين مرونة العضلات.
3- تحسين الدورة الدموية والتأثير على نبضات القلب.
4- تحسين منظومة الجهاز الهضمي وتنظيم عملية الهضم.
5- تحفيز الجهاز المناعي وتحسين وظائف المخ وتحسين التركيز والتنبيه.
6- خفض مستوى الكورتيزول المفرط في الدم وهو هرمون التوتر.
7- تحسين نوم الإنسان وتخفيف الأرق.
8- تحسين نسبة الأكسجين في الجسم وتغذيتها.