تواجه المؤسسات المالية العديد من المشاكل والصعوبات، منها:
1- التحديات التقنية: مع التطور المتسارع في التقنيات المالية، يواجه المؤسسات المالية الصعوبة في مواكبة هذه التحديثات واستخدامها بشكل فعال.
2- التغييرات الاقتصادية: تتعرض المؤسسات المالية للتحديات الاقتصادية المختلفة والتي تشمل التضخم والركود الاقتصادي وارتفاع نسبة الفائدة وغيرها.
3- المنافسة الشديدة: تجد المؤسسات المالية نفسها في منافسة شديدة مع المؤسسات المالية الأخرى، لجذب العملاء وتقديم خدمات متميزة.
4- القوانين والتنظيمات: تتعرض المؤسسات المالية لقوانين صارمة وتنظيمات دقيقة للحفاظ على الاستقرار المالي وضمان عدم تكرار الأزمات المالية الماضية.
5- ضغوط العملاء: يتوقع العملاء من المؤسسات المالية توفير خدمات مبتكرة ورضا العملاء وتسهيل الإجراءات وتحسين جودة الخدمات والأداء بشكل عام.