يتعرض علم الإنسان لمجموعة من المشاكل السوسيولوجية التي تؤثر على تطوير وفهم العلم وتشمل:
1. الموضوعية: يعاني علم الإنسان من صعوبة في تحقيق الموضوعية في بياناته، لأن كثيرًا من الأبحاث يتم تنفيذها على أساس المرئيات الشخصية والتجارب الفردية.
2. الاختلافات الثقافية: تعتمد دراسات علم الإنسان بشكل كبير على مقارنة النتائج بين مجموعات مختلفة من البشر، ولكن يوجد اختلافات كبيرة في الثقافات واللغات والمعتقدات بين هذه المجموعات.
3. الإنحياز والتحيز: يصعب تفادي الإنحياز والتحيز في بعض الدراسات بسبب الميل المحتمل للباحثين لتقبل النتائج التي تؤيد موقفهم أو فرضية الدراسة.
4. القوة الاجتماعية: تؤثر القوى الاجتماعية المختلفة مثل الطبقية والجنسية والعرقية على تجربة الأفراد ومعرفتهم، ويمكن أن يؤثر هذا التأثير على فهم علم الإنسان.
5. الاتجاهات الفلسفية: يعتبر علم الإنسان مجالًا интерديسبلينيًا والعديد من الخلافات الفلسفية والفكرية الأخرى يمكن أن تؤثر على تفسير النتائج العلمية والتفاعل بين العلماء.