هناك العديد من المخطوطات التي تحتوي على الفلسفة والمنطق والعلوم البحتة، منها ما يلي:
1- مخطوطات أرسطو، وهي مجموعة من المخطوطات التي قام بها الفيلسوف اليوناني أرسطو، وتشمل أعمالاً ضخمة مثل “ميتافيزيقيا” و”الفيزياء” و”الأخلاقيات”.
2- “المخطوطات النجمية” للعالم الفارسي المسلم البيروني، والتي تحتوي على معرفة الفلك والرياضيات وغيرها من المواضيع العلمية.
3- “المخطوطات الإسلامية”، وهي مجموعة من المخطوطات التي تحتوي على الفلسفة والمنطق والعلوم البحتة، والتي قام بها العلماء المسلمون مثل الفارابي وابن سينا وابن رشد وغيرهم.
4- “المخطوطات السامية”، وهي مجموعة من المخطوطات التي تحتوي على الفلسفة والمنطق والعلوم البحتة، والتي قام بها العلماء اليهود والمسيحيون مثل موسى بن ميمون (مايمونيدس) وأوغسطين وتوماس أكويناس.