تشمل المخاطر المرتبطة بالبراكين البحرية:
1- تسونامي: يمكن للبراكين البحرية التي تحدث تحت سطح الماء أن تسبب تسونامي مدمرًا. ينتج ذلك عن الزلازل البركانية والانزياح السطحي السريع للمياه.
2- البراكين البحرية النشطة: يمكن أن تتسبب البراكين البحرية النشطة في التعرض للحمم والرماد البركاني، الأمر الذي يمكن أن يؤثر على الحياة البحرية والموارد الاقتصادية البحرية.
3- الانبعاثات الغازية: يمكن أن تتسبب البراكين البحرية في انبعاثات غازية مثل ثاني أكسيد الكربون والكبريت التي يمكن أن تؤثر على البيئة البحرية والهواء.
4- التلوث: يمكن أن تتسبب البراكين البحرية في تلوث البحر بمخلفات الرماد البركاني والمواد الكيميائية المنبعثة من الحمم البركانية.
5- تأثير على المناخ: يمكن أن تسبب البراكين البحرية الكبرى الانبعاثات الغازية الكبيرة والدخان والسحابة السوداء التي يمكن أن تؤثر على المناخ العالمي وتؤدي إلى تغيير في درجات الحرارة وزيادة في ظاهرة الاحتباس الحراري.