هناك عدة مخاطر مرتبطة باستخدام تطبيقات الهاتف المحمول والهواتف الذكية، ومنها:
1- فقدان الخصوصية: قد يتعرض المستخدم لفقدان الخصوصية بسبب تقديم معلومات شخصية لا قدر الله للغير أو استخدام تطبيقات لها صلاحيات للوصول إلى معلومات شخصية.
2- الاحتيال والاحتيال الإلكتروني: يمكن تقديم تطبيقات برامج ضارة تستهدف التجسس على بيانات المستخدم أو احتيال المستخدمين من خلال رسائل البريد الإلكتروني الوهمية.
3- زيادة الإدمان: قد يتعرض المُستخدمون لزيادة الإدمان على استخدام التطبيقات ، والتي تؤثر في نوعية الحياة الاجتماعية والعملية.
4- تشتيت الانتباه: يمكن للتطبيقات أن تشتت انتباه المستخدم وتؤثر بشكل كبير عليه في العديد من عمليات الحياة اليومية.
5- التعرض للإعلانات الغير مرغوبة: يمكن لبعض التطبيقات إظهار الإعلانات المزعجة أو التلقائية للوصول إلى التطبيق أو الموقع.
6- الاعتماد على التكنولوجيا: نظرًا لأن تطبيقات الهواتف والهواتف الذكية توفر سهولة استخدام للمستخدم ، فإن البعض يعتمد بشكل كبير على هذه التكنولوجيا ليجد الحلول لمشاكلهم اليومية بدلاً من البحث عن حلول عادية.