يتناول كتاب تهافت التهافت لابن رشد محاور أساسية عدة، منها:
1- توضيح الفرق بين العلم والأديان، وضرورة استنارة الحكم بالعلم وعدم التشدد في الدين.
2- الرد على العقائد الخاطئة والمعتقدات المغلوطة التي تنتشر في الأديان المختلفة، مثل الاتجار بالأسرى وتعذيب النفوس في القبر وغيرها.
3- توضيح مفهوم النص الديني وكيفية تفسيره وفهمه بطريقة صحيحة، وضرورة نقل المعاني بحسب السياق الذي نزل فيه النص.
4- الحديث عن العلوم الفلسفية والمنطقية، وكيفية استخدامها في فهم العقائد الدينية والإجابة عن الشبهات.
5- الحديث عن العالم الروحي والنشأة الروحية للإنسان، وتوضيح العلاقة بين الروح والجسد وكيفية عملهما معًا.
6- الرد على الأسئلة المتعلقة بالقضايا الهامة، مثل الحرية والتقدير والخلود وغيرها.