يعتمد ابن القيم الجوزية في فهم العلوم الشرعية على العديد من القواعد والمنهجيات، منها:
1- الاستنباط: وهو استخلاص معنى المسألة والحكم الشرعي من الأدلة الشرعية المستخدمة، سواء كانت من القرآن الكريم أو السنة النبوية أو الأقوال والآراء المأثورة للعلماء.
2-التحقق والتدقيق: وهو التحقق من صحة الأدلة والروايات والتأكد من صحة وثبوت الحقيقة الشرعية، وعرض النتائج على أسس وثوابت مفروضة.
3-الجمع بين العلم والعمل: وهو العمل بما يتوافق مع العلم، فالعلم يوصل المؤمن إلى الطريق الصحيح، والعمل يجعل المؤمن يعيش الحكمة.
4-الاعتدال والتوازن في الرأي: حيث يحاول ابن القيم الجوزية دائمًا الوصول إلى الرأي المعتدل والتوازن في الأمور المختلفة، ويحاول أن يجمع بين النصوص الشرعية والواقع الحياتي للمجتمعات.
5-التحليل البنيوي: وهو فن التحليل الدقيق للنصوص الشرعية، من حيث النحو والصرف والإعراب وغيرها من الأمور اللغوية والنحوية.
6-الاهتمام بالظواهر الخارجية والداخلية: حيث يركز ابن القيم الجوزية على دراسة الظواهر الخارجية والداخلية المرتبطة بالعلوم الشرعية، ويبحث عن تفسير هذه الظواهر بطريقة دقيقة وعلمية.