تختلف الشيعة والسنة في فهمهم لعلم الكلام في بعض النقاط الأساسية. ومن أبرز هذه الفروقات:
1- النظرية الكونية: يتفق الشيعة والسنة في معظم نظرياتهم الكونية. ومع ذلك ، يختلفون في بعض النقاط الصغيرة والأدق في تفسير الآيات القرآنية والحديث النبوي.
2- توحيد الله: يختلف الشيعة والسنة في بعض الجوانب في توحيد الله، حيث يعتقد الشيعة بوجود الإمامة والمهدي، في حين أن السنة لا يعتقدون في وجود الإمامة وحضور المهدي.
3- الكتب الإسلامية: يختلف الشيعة والسنة في الكتب الإسلامية التي يعتمدون عليها ، فالشيعة يعتمدون على الكتب الخاصة بهم مثل القرآن الكريم، ونهج البلاغة، والصحيفة السجادية. بينما السنة يعتمدون على القرآن والسنة النبوية.
4- الإمامة: يعتقد الشيعة بوجود الإمامة الإلهية التي تتبع معها الخلافة. بينما السنة يؤمنون بأن القيادة في الأمة الإسلامية يجب أن تنتقل عبر الانتخابات والتصويت.
5- التقليد: يعتمد الشيعة على المراجع الشرعيين في التقليد الديني ، بينما تشجع السنة الاستقلال المذهبي والفكري.
6- البحث والاستنتاج: يعتمد الشيعة على الاستنتاج العقلاني للحكم واستخلاص أحكام شرعية، بينما يتطلع السنة لما يقوله النبي وإجمالي الأمة الإسلامية في أحكامهم ومستنداتهم الدينية الأخرى.