تمر العلاقة بين دول حوض النيل وتاريخ السودان بفترات مختلفة. لقد كانت الدول المشاركة في حوض النيل، بما في ذلك السودان، قد أنشأت حضاراتٍ عريقة على ضفاف النيل قبل 5000 سنة، وقد استخدم هذا النهر كمنبع للحياة والتجارة والحضارة.
وفي العصر الحديث، شهدت العلاقات بين دول حوض النيل – بما في ذلك السودان – صعوبات كبيرة بسبب الصراع على حصة كل دولة من حصة المياه في النيل. وعلى الرغم من التوترات السياسية والاقتصادية المستمرة، لا تزال دول حوض النيل تعتبر واحدة من أكثر المناطق استراتيجية في القارة الأفريقية، وتحاول الدول المشاركة فيها تشكيل تحالفات اقتصادية وسياسية لتحقيق الاستقرار وتطوير المنطقة بشكل دائم.