ترتبط الفدرالية السياسية والاقتصاد السياسي بطريقة وثيقة، حيث تؤثر العوامل الاقتصادية على الشكل الذي يتخذه تنظيم الفدرالية السياسية وعكسًا، يؤثر تنظيم الفدرالية السياسية على الاقتصاد وسياساته.
في النظم الفدرالية، تتم رعاية القضايا الاقتصادية وغيرها من المسائل من خلال السلطات المحلية والإقليمية، وبالتالي يؤثر التنظيم الفدرالي في تحديد سياسات المستويات الأقل والمرتبة الأعلى من الحكومة المركزية. وعلى العكس من ذلك، تؤثر العوامل الاقتصادية مثل الاستثمار والتجارة والعملات في العلاقات الفدرالية والتعاون بين المناطق المختلفة.
وبالتالي، فإن الفدرالية السياسية والاقتصاد السياسي يتفاعلان في بناء السياسات والاستراتيجيات الاقتصادية والاجتماعية والبيئية وغيرها، وتحديد مستويات الحكومة والتكامل بين المناطق والدول والحكومات الفرعية المختلفة.