تواجه الإدارة الاقتصادية العديد من العقبات، ومن أهمها:
1- عدم وجود بيانات موثوقة ودقيقة حول الأسواق والمستهلكين والمنافسين.
2- التحديات القانونية والمالية، حيث يتطلب التعامل مع مجموعة من اللوائح والتشريعات والزكاة والضرائب.
3- تقلبات السوق، حيث تتغير الأسعار وتتوفر صناعات جديدة في نفس الوقت التي تصبح صناعات أخرى غير رائجة، مما يتيح للشركات كسب الأرباح في بعض الأحيان وفقدان المزيد من الأموال في الأحيان الأخرى.
4- سوء الإدارة وضعف التخطيط، فالقيادة العادية وعدم الاهتمام بالتخطيط يمكن أن تؤدي إلى الفشل في عملية إدارة الأعمال.
5- عدم القدرة على اتخاذ القرارات الصحيحة في الوقت المناسب، حيث يمكن أن يؤدي ذلك إلى فقدان العملاء وسوء إدارة الشركة.
6- عدم توافق الثقافة المؤسسية مع الأهداف العامة للعمل.