تتضمن الصفات الفسيولوجية للجراثيم ما يلي:
1- التغذية: الجراثيم قادرة على العيش والتكاثر من خلال استهلاك العناصر الغذائية المختلفة مثل الكربوهيدرات والبروتينات والدهون.
2- التنفس: يعتمد نوع الجرثيم على نوع التنفس الذي يستخدمه للحصول على الطاقة. قد يكون من النوع اللاهوائي (لا يحتاج إلى الأكسجين) أو الهوائي (يحتاج إلى الأكسجين).
3- التكاثر: يختلف نوع الجرثيم في طريقة التكاثر والتضاعف. يمكن أن يكون التكاثر جنسياً أو غير جنسي.
4- الفسفاتة: يستخدم الجراثيم الفسفاتة للتمتع بأهمية بيوكيميائية عندما ترتبط بالمركب المعني.
5- التبادل المائي: يجب على الجراثيم الحفاظ على توازن مائي داخلية، مما يتطلب إفراز سوائل أو امتصاص السوائل من البيئة المحيطة.
6- الحركة: الجراثيم قد تكون قادرة على الحركة بفعل ذيل الجيوب أو فتات الأسطوانة أو طرف الخيط.