هناك عدة صعوبات تواجه بناء التلسكوبات الفضائية منها:
1- تصميم متطور: يتطلب بناء التلسكوبات الفضائية تصميمًا دقيقًا ومتطورًا يضمن الحصول على صور عالية الجودة والتحقق من أن جميع الأجزاء تعمل بالشكل المطلوب.
2- البعد الأمني: بما أن التلسكوبات الفضائية توضع في الفضاء بعيدًا عن الأرض، فهي تتعرض للعديد من التحديات والمخاطر مثل الإشعاعات والتبخر وعدم الاستقرار الجوي.
3- التحكم عن بعد: بما أن التلسكوبات توضع في الفضاء، يصعب الوصول إليها لإجراء أي تغييرات في حالة وجود عطل فيها، ولذلك يتم تحميلها بأنظمة حاسوبية وميكانيكية تسمح بالتحكم عن بعد.
4- تمويل مكلف: بناء التلسكوبات الفضائية يتطلب ميزانية بالمليارات من الدولارات لتصميم وتطوير وإطلاقها إلى الفضاء، وهذا يجعلها تكلفة باهظة الثمن.
5- العمر الافتراضي المحدود: تعاني التلسكوبات الفضائية من مشكلة العمر الافتراضي المحدود، حيث تصبح قديمة وتتطلب الكثير من التحديثات والصيانة الدورية بمرور الوقت.