تشمل الحقول الفرعية للكيمياء الحيوية العديد من المجالات والتخصصات الشمولية ، والتي تتضمن على سبيل المثال لا الحصر:
1- العلوم الحيوية الكيميائية
2- الكيمياء الفيزيولوجية
3- الكيمياء الحيوية الهيكلية
4- العلوم الطبية
5- الكيمياء الحيوية الآلية
6- الكيمياء الحيوية البيئية
7- التحكم البلوري للبروتينات
8- تقنية الحمض النووي
9- الكيمياء الحيوية المتطورة
10- علم الأحياء الجزيئي
11- الكيمياء الحيوية التشريحية
12- البيولوجيا الهيكلية والوظيفية.