تصميم البروتينات باستخدام التصميم الحاسوبي يمكن أن يستخدم في العديد من التطبيقات الصناعية، بما في ذلك:
1- الأدوية: يساعد هذا التصميم في تصميم الأدوية التي تستهدف أهداف معينة بدقة وكفاءة.
2- الزراعة: يمكن أن يستخدم تصميم البروتينات لتحسين النباتات والحيوانات لتحقيق خصائص معينة، مثل زيادة المقاومة للظروف البيئية القاسية.
3- التصنيع الصناعي: يمكن أن يتم استخدام التصميم الحاسوبي لتصميم بروتينات لتحل مشكلات في عمليات التصنيع الصناعي.
4- التشخيص الطبي: يمكن استخدام تصميم البروتين لتشخيص الأمراض وتصميم الأدوية الفعالة والآمنة.
5- العلوم البيئية: يمكن استخدام تصميم البروتين في دراسة الإنزيمات والميكروبات والخلايا الحية وتطوير طرق جديدة لتحليلها.