توجد عدة تدابير لمنع تلوث الموارد المائية على الساحل ومن أهمها:
1- إعادة تدوير المياه المستخدمة في المناطق الساحلية.
2- استخدام تقنيات الصرف الصحي الحديثة لمعالجة المياه قبل إعادتها إلى المصب الرئيسي.
3- التحكم في تصريف المخلفات الصناعية والزراعية وتخزينها بشكل ملائم.
4- الاستخدام الأمثل للمواد الكيميائية المستخدمة في الزراعة والصناعة لتقليل التسرب إلى المياه والتربة.
5- توعية الجمهور بأهمية الموارد المائية وتشجيعه على الحفاظ عليها.
6- إنشاء مناطق حماية بحرية للحفاظ على الأحياء البحرية والحيوانات النادرة.
7- تخصيص موارد للأبحاث العلمية المتعلقة بالموارد المائية وتطوير التكنولوجيا للحد من التلوث.