توجد عدة تحديات متعلقة بجمع البيانات في التحليل الرياضي المركب، ومنها:
1- جمع البيانات من مصادر متعددة: يواجه المحللون تحديًا في جمع البيانات من مصادر متعددة خاصة عندما يتعلق الأمر بالرياضات المختلفة مثل كرة القدم والكريكيت وكرة السلة وغيرها.
2- جمع البيانات الكمومية: يتطلب تحليل الرياضات المركبة جمع بيانات كمومية تتضمن جهات خامسة، مما يجعل من الصعب جمع البيانات الكافية من كل جهة، وأحيانًا يحتاج المحللون إلى جعل تقديرات لملء الفجوات في البيانات.
3- تحليل البيانات المرتبطة: يصعب جمع البيانات المرتبطة المتعلقة بالأداء الرياضي للاعبين في الوقت الفعلي، وقد يتطلب هذا الأمر استخدام أدوات مثل أجهزة الاستشعار القابلة للارتداء والتحليل الفوري للبيانات.
4- صعوبة جمع البيانات عن اللاعبين: يعمل العديد من الفرق الرياضية على الحفاظ على بيانات اللاعبين بمستوى ارتفاع للغاية، وقد يصعب تحصيل بعض هذه البيانات بسبب القيود المفروضة على الوصول إلى لاعبي الفريق.