1- المعارضة من الكنيسة: كانت الكنيسة تعتبر تصورات جاليليو جنونية ومخالفة لتعاليم الكتاب المقدس، مما أدى إلى تعرضه للتهديد والتحدي من قبل الكنيسة.
2- صعوبة الوصول إلى المعدات والأدوات التي يحتاجها في بحوثه.
3- مشاكل مع الترجمة: لم يتاح لجاليليو مصادر كافية للغة العربية واليونانية واللاتينية لذا كان عليه التعامل مع التحديات اللغوية لالتقاط أفكار الفلاسفة السابقين.
4- الكثير من التعقيدات في التجارب والاختبارات والنظريات التي قام بها.
5- تحديد موقع وتحديد الأفكار الممكنة للبحث ، وأيضًا كيفية توصيل المعلومات العلمية بطريقة سلسة ومتناسقة لفهم الجمهور.