تواجه المجتمعات المحلية العديد من التحديات عند تنفيذ مشاريع البناء الاجتماعي، ومن بين هذه التحديات:
1- عدم التزام بعض الأفراد والمجتمعات بالتطورات الاجتماعية والتكنولوجية الجديدة، مما يؤثر على قدرتهم على الاستفادة من المشاريع الاجتماعية.
2- عدم وجود مصادر تمويل كافية، مما يجعل من الصعب إنجاز المشاريع بشكل كامل.
3- عدم التوافق بين مختلف الأطراف، مما يسبب تأخر في إنجاز المشروع أو إلغائه تمامًا.
4- صعوبة تحديد الأولويات والاحتياجات الحقيقية للمجتمعات، وبالتالي صعوبة اتخاذ القرار الصائب بشأن وجودية المشروع ومدى تأثيره على المجتمع.
5- صعوبة اجتذاب الكفاءات والمهارات اللازمة لتنفيذ المشاريع واستمرارها، وخصوصاً إذا كانت المنطقة تعاني من نقص في العمالة المؤهلة والمتخصصة.