تواجه الأدب الإختلافي العربي العديد من التحديات، منها:
1- قلة الإهتمام والدعم الحكومي والإعلامي، حيث لا تحظى الأعمال الإختلافية بالتركيز الكافي من قبل الجهات الرسمية ووسائل الإعلام.
2- الأحكام المسبقة والتمييز المجتمعي، حيث يواجه الكتاب والمؤلفون من الجنسيات والتيارات الأخرى معارضة وانتقادات بسبب اختلاف تعاليمهم وثقافاتهم.
3- عدم التعاون بين الكتاب والناشرين والمترجمين من مختلف الجنسيات، مما يعيق نشر وتوزيع الأعمال الإختلافية في المناطق والدول الأخرى.
4- القيود والقوانين التشريعية التي تحد من حرية التعبير عن الأفكار الإختلافية والجريئة التي تخالف التقاليد والعادات الاجتماعية.
5- ضعف الإصدارات الأدبية التي تروج للأعمال الإختلافية، مما يجعلها أقل شهرة وانتشارًا بين الجمهور.