توجد العديد من التحديات التي تواجه إدارة المصانع في الوقت الحالي ، ومن بين هذه التحديات:
1- العمالة: يوجد نقص في العمالة الماهرة في العديد من المجالات ، مما يؤثر على القدرة على تحقيق الإنتاجية وتلبية الطلبات.
2- التكنولوجيا: يجب على المصانع تحديث تقنية المعدات والبرمجيات في العملية الإنتاجية لتلبية المتطلبات الحديثة.
3- الجودة: تحسين الجودة وتلبية متطلبات العملاء يجب أن يكون هدفًا رئيسيًا لأي مصنع.
4- الصعوبات التجارية: توجد تحديات تجارية متعددة التي يمكن أن تؤثر سلبًا على الإنتاجية والربحية مثل الغلاء في سعر الوقود والنقل والتجارة الدولية.
5- التنظيم: تحتاج إلى تنظيم كبير لتحسين العمل ولتجنب التأخير في الإنتاج واضاعة الوقت.
6- الاستدامة: توجد اهتمامات جماعية في الوقت الحالي بالاستثمار في التحوّل البيئي والأخذ في الاعتبار عوامل الاستدامة في العمل.