يمكن استخدام العديد من البيانات الجزيئية لدراسة الأحياء البحرية، ومنها:
1- التسلسل الجيني: حيث يمكن استخدام تسلسل الحمض النووي (DNA) لتحديد النوع والتصنيف الجيني للكائنات البحرية.
2- البروتينات: يمكن دراسة البروتينات الموجودة في أنسجة الكائنات البحرية لتحديد وظائفها والتعرف على الفرق بين الأنواع المختلفة.
3- البروتينات المناعية: يمكن دراسة البروتينات المناعية الموجودة في الدم والأنسجة لتحديد تأثيرات العوامل البيئية والتلوث على الكائنات البحرية.
4- الرونيات: يمكن دراسة الرونيات الموجودة في الدم والأنسجة لتحديد الفرق بين الأنواع المختلفة وتحديد تأثير العوامل البيئية على الكائنات البحرية.
5- الليبيدات: يمكن دراسة الليبيدات الموجودة في الأنسجة لتحديد تأثير العوامل البيئية على الكائنات البحرية وتقييم مدى التلوث البيئي للمناطق البحرية.