هناك العديد من الأنظمة المتكاملة المستخدمة في التجارة الإلكترونية، ومن بينها:
1. نظام إدارة المحتوى (CMS): يستخدم هذا النظام لإدارة المحتوى والصفحات على الموقع التجاري.
2. نظام إدارة البيانات (DMS): يستخدم لإدارة البيانات والمعلومات عن المنتجات والخدمات والعملاء.
3. نظام إدارة العلاقات مع العملاء (CRM): يستخدم لإدارة علاقات العملاء وتسجيل العمليات المالية والتواصل مع العملاء.
4. نظام إدارة الأوردرات (OMS): يستخدم لإدارة الأوردرات والشحن والتسليم للمنتجات.
5. نظام إدارة الأسهم (IMS): يستخدم لإدارة المخزون والأسهم للمنتجات المباعة والغير مباعة.
6. نظام الدفع الإلكتروني (EPS): يستخدم لعمليات الدفع الإلكترونية والتأكيد على العمليات المالية والتحقق منها.
7. نظام التسويق الإلكتروني (EMM): يستخدم لتطوير حملات التسويق الإلكتروني وتحليل البيانات وتصيّرها.
8. نظام الحماية الامنية (SW): يستخدم لحماية من الهجمات والمخاطر الامنية المتعددة.