تستخدم الفيزياء الحيوية العديد من الأدوات والتقنيات المتطورة، ومن بينها:
1- المجهر الإلكتروني: وهو جهاز يستخدم لتكبير الأشياء الدقيقة جداً مثل الخلايا والأنسجة، ويعمل بإنتاج صورة ثلاثية الأبعاد للعينة.
2- الطيفومتر: وهو جهاز يستخدم لتحليل الضوء المنبعث من العينة، ويسمح بتحديد خواص المركبات الكيميائية الموجودة في العينة.
3- السكانر: وهو جهاز يستخدم لتحليل الأشعة السينية وإنتاج صورة العينة، ويستخدم عادة في الأبحاث الطبية.
4- جهاز الموجات فوق الصوتية: وهو جهاز يستخدم لتحليل الأصوات العالية التردد التي تنتجها الأنسجة الحية، ويستخدم في التشخيص الطبي.
5- الرنين المغناطيسي: وهو جهاز يستخدم لتحليل الصورة الداخلية للجسم، ويستخدم عادة في التشخيص الطبي للأمراض المزمنة والأورام السرطانية.