تختلف الأدوات التي تستخدم في إدارة تصميم المصانع باختلاف مراحل التصميم ونوع المصنع والصناعة المعنية. ومن بين الأدوات المشهورة والتي يمكن استخدامها في إدارة تصميم المصانع:
1- برامج الرسم الهندسي مثل AutoCAD و SolidWorks و CATIA وغيرها.
2- برامج النمذجة العملية مثل Aspen Plus و HYSYS.
3- برامج المحاكاة مثل Arena و FlexSim و AnyLogic.
4- أدوات تحليل البيانات مثل Excel و Minitab وغيرها.
5- برامج إدارة المشاريع مثل Microsoft Project و Primavera.
6- برامج التصميم الإلكتروني PCB مثل Altium Designer و Eagle PCB.
7- القوائم المرجعية والتعليمات الفنية والمعايير الصناعية المختلفة.
8- النماذج المصغرة والنماذج ثلاثية الأبعاد.
9- الأدوات التي تساعد على تحليل الوقت وإدارة المخاطر والتحكم في التكاليف.
10- الأدوات التي تساعد على تحسين عمليات التصنيع وزيادة الإنتاجية وتحسين الجودة.