تختلف الآلات الزراعية المستخدمة في إنتاج الفطر حسب الطريقة المستخدمة في الإنتاج، ولكن بشكل عام فإنه يتم استخدام الآت زراعية متخصصة في عمليات الحصاد والتنظيف والتجهيز للمنتج النهائي، ومن بين هذه الآلات:
1- آلة الحصاد: وهي تستخدم لجمع المحصول من الزرع وتسهل عملية القطع والتقطيع.
2- آلة التلقيح: وهي تستخدم في عملية التلقيح بين الفطر والمادة العضوية المستخدمة في الإنتاج.
3- آلة الغربلة: وهي تستخدم في عملية التنظيف والفرز للمنتج النهائي.
4- آلة التعبئة: وهي تستخدم في عملية التعبئة والتغليف للمنتج النهائي.
5- آلة التحلية: وهي تستخدم في عملية إزالة الأملاح والمواد الضارة من الماء المستخدم في الإنتاج.