يوجد العديد من الآفات التي تهدد زراعة الفواكه والخضروات، ومن بينها:
1- الآفات الحشرية: مثل الذبابة الفاكهة والثعبان الدودي والذبابة البيضاء والعنكبوت الأحمر والحشرات الأخرى.
2- الآفات الفطرية: مثل العفن الأسود والعفن الأبيض والبياض الدقيقي والصدأ الدقيقي والإنقاذ المتأخر وغيرها.
3- الآفات الجرثومية: مثل التربة الفساد والجذام النباتي والزهري الحمضي والتدرن الحلو والبكتيريا الأخرى.
4- الآفات الميكانيكية: مثل الرياح والكارثة الطبيعية والزلازل والأمراض الجوية الباردة والحرارية والمرضى النباتية والأخرى.
علاوة على ذلك، تتوقف أنواع الآفات المحتملة على نوع الفاكهة أو الخضار وطريقة الزراعة وغيرها من العوامل.