تهتم هندسة التربة المائية بدراسة وتصميم المنشآت والأنظمة المائية والصرف الزراعي وإدارة الموارد المائية، وتشمل أوجه الاهتمام العلمي في هندسة التربة المائية ما يلي:
1- دراسة خصائص التربة والتركيب الجيولوجي لمعرفة قدرة التربة على الترشيح والاحتفاظ بالمياه.
2- التصميم والتنفيذ لمنشآت تخزين المياه وآبار الري و تصريف السيول والأنهار والبحيرات لضمان توفير مياه جيدة الجودة.
3- إدارة الموارد المائية والتخطيط الاستراتيجي الهادف إلى تحقيق التوازن بين العرض والطلب على المياه في جميع القطاعات التي تحتاجها.
4- توفير معدات ومواد تكنولوجية تحسن من جودة المياه وتقلل من تكلفة المعالجة والتخزين.
5- العمل على تحسين نظم الري والصرف الزراعي لتقليل انتهاكات المياه وتوفير المياه الزراعية للزراعة.
6- تطوير وتطبيق نظم الاستشعار البعيد للرصد والتحليل لحالات المياه وتوقع الفيضانات وإدارتها.
7- زيادة الوعي والتوعية بالقضايا البيئية وحماية واستدامة الموارد المائية في البيئات المختلفة.