تشمل أهم قضايا حقوق الإنسان في فلسطين:
1- حق اللاجئين الفلسطينيين في العودة إلى ديارهم الأصلية.
2- التمييز والانتهاكات اليومية التي يتعرض لها الفلسطينيون في الأراضي المحتلة الفلسطينية الشرقية (الضفة الغربية والقدس الشرقية).
3- إنتهاكات حقوق الإنسان وانتهاكات حقوق المدنيين في قطاع غزة بما فيها الحصار المفروض على القطاع.
4- التعذيب والمحاكمات الجائرة والاعتقال التعسفي للفلسطينيين.
5- نهب الموارد الطبيعية والاستيلاء على الأراضي الفلسطينية.
6- الاضطهاد الديني والعرقي والثقافي الذي يتعرض له الفلسطينيون في إسرائيل.
7- حرمان الأسرى الفلسطينيين في السجون الإسرائيلية من حقوقهم الأساسية.