تشمل أهم المشاريع البحثية في علم الأحياء البحرية العميقة:
1- مشروع “Ocean Observatories Initiative” الذي يهدف إلى توفير بنية تحتية للبحث ورصد الأحياء البحرية العميقة في المحيطات العالمية.
2- مشروع “Census of Marine Life” الذي يهدف إلى توثيق ودراسة التنوع الحيوي في المحيطات، بما في ذلك الأحياء البحرية العميقة.
3- مشروع “Deep-Sea Biology” الذي يركز على دراسة الأحياء البحرية العميقة وتطورها وعلاقتها بالبيئة البحرية العميقة.
4- مشروع “Challenger Deep Expedition” الذي يهدف إلى استكشاف أعماق المحيطات ودراسة الأحياء البحرية العميقة في أعماق تصل إلى 11 كيلومتر.
5- مشروع “Hydrothermal Vent Research” الذي يركز على دراسة الأحياء البحرية العميقة التي تعيش حول فتحات الهواء الساخنة في قاع المحيطات.