تواجه المدراء في الإدارة الاقتصادية العديد من التحديات، من بينها:
1- اتخاذ القرارات الصحيحة: يواجه المديرون في الإدارة الاقتصادية تحديات في اتخاذ القرارات الصحيحة بناءً على المعلومات والتوقعات الاقتصادية والسياسية والاجتماعية.
2- التحكم في التكاليف: تتطلب الإدارة الاقتصادية التحكم في التكاليف والإنفاق والعمل بكفاءة لتحقيق أعلى قدر من الربحية وضمان استمرارية العمل.
3- التغييرات في السوق: يواجه المدراء في الإدارة الاقتصادية التحديات في التعامل مع التغييرات السريعة في السوق وتطور التكنولوجيا وتغير الاحتياجات والرغبات الاستهلاكية.
4- إدارة فريق العمل: تعتبر الإدارة الناجحة لأي مؤسسة اقتصادية تحدٍ كبير، لأنها تتطلب قدرات إدارية عالية لإدارة العمال وتوجيههم وتحفيزهم.
5- الامتثال للقوانين واللوائح: تتطلب الإدارة الاقتصادية الامتثال للعديد من القوانين واللوائح التي تنظم العمل في البلدان المختلفة، وهي تحديات تعرقل نجاح الأعمال التجارية.