تعتبر الكيمياء الفوق جزيئية (Supramolecular chemistry) من المجالات الحديثة في الكيمياء وتهتم بدراسة التفاعلات والتركيبات بين الجزيئات والمركبات الكبيرة كالبوليمرات والبروتينات والشحوم والسكريات والكربوهيدرات. تستخدم الكيمياء الفوق جزيئية في تصميم وتحضير المركبات الدوائية والصناعات الأخرى بشكل فعال ودقيق.
أحد التطبيقات الهامة للكيمياء الفوق جزيئية في تصنيع الدواء هو تصميم وتحضير المركبات الفعالة والانتقائية والتي تستهدف بشكل محدد مواقع معينة في الجسم للوصول إلى أمراض معينة مثل الأورام والأمراض العصبية والأمراض المناعية والأمراض المعدية. كما تستخدم الكيمياء الفوق جزيئية في تصنيع الأدوية التي لها صيغ إيجابية وذلك بتكوين مركبات مصاصة للماء لزيادة امتصاص الدواء من المعدة وزيادة تركيزه في الدم.
بالإضافة إلى ذلك، تستخدم الكيمياء الفوق جزيئية في العديد من الصناعات الأخرى مثل صناعة الأغذية ومواد التجميل والمواد البوليمرية. ففي صناعة الأغذية، يتم استخدام المواد الفوق جزيئية للحصول على خصائص محددة في المواد مثل التماسك والقوام والتشكيل الشكلي، كما تستخدم في صناعة المواد البوليمرية للحصول على خصائص محددة مثل المرونة والصلابة والتحمل الحراري.
بالنهاية، يمكن القول إن الكيمياء الفوق جزيئية تعد من الأدوات الحديثة القوية التي تساعد في تحسين صناعات عديدة وخاصة الدوائية لتحقيق أهداف علاجية ووظيفية محددة.