يتم إجراء العديد من الأبحاث في دراسة الإسفنج، ومنها:
1. دراسات التشريح والفيزيولوجيا: يهدف الباحثون من خلال هذه الدراسات إلى فهم تركيب الإسفنج ووظائفها الحيوية والتحولات الجزيئية التي تحدث فيها.
2. دراسات الانتشار الزمني: هناك بعض الإسفنجيات التي تعتبر أقدم كائنات حية على الأرض، لذلك تتطلب دراسة هذه الأنواع دراسات الانتشار الزمني والعمر الجيولوجي للاستنتاجات المفيدة.
3. دراسات النظام: يوجد عدد كبير من الأنواع المختلفة للإسفنج، وتحتاج دراسة كل منها إلى تحديد خصائصها وأهميتها في البيئة.
4. دراسات الدور البيئي: تحتاج الأحياء المجهرية التي تعيش على سطح الإسفنج إلى دراسة دورها في البيئة وانتقال المغذيات والطاقة وغيرها.
5. دراسات الوراثة والتطور: يهدف هذا النوع من الأبحاث إلى فهم الآليات الوراثية والتطورية التي وراء اختلافات الإسفنج، وكيف يتكيفوا مع بيئتهم المحيطة.