هناك عدة أنظمة تشغيل يمكن استخدامها في شبكات الحاسوب، ومن بينها:
1- ويندوز سيرفر: هو نظام تشغيل يعتمد عليه العديد من الشركات والمؤسسات لإدارة شبكاتها، ويتميز بسهولة الاستخدام وتوفير العديد من الخدمات والأدوات اللازمة لإدارة الشبكات.
2- لينكس: وهو نظام تشغيل مفتوح المصدر يستخدم في العديد من شبكات الحاسوب، ويتميز بالأمان والاستقرار والقدرة على التعديل والتخصيص.
3- ماك أو إس إكس سيرفر: وهو نظام تشغيل مصمم من قبل شركة آبل للاستخدام في الشبكات، ويتميز بالأمان والاستقرار والتوافق مع أجهزة آبل.
4- يونيكس: وهو نظام تشغيل يستخدم في العديد من الشبكات الكبيرة والمؤسسات الحكومية، ويتميز بالأمان والاستقرار والقدرة على التعديل والتخصيص.
يتوقف اختيار النظام على احتياجات الشبكة وميزانية الشركة أو المؤسسة التي تدير الشبكة.