تختلف أنظمة الإنتاج في هندسة الحفر حسب الطريقة المستخدمة في الحفر وتقنية الحفر المستخدمة. ومن هذه الأنظمة:
1- نظام الحفر بالطرق اليدوية، حيث يستخدم العمال مطارق يدوية للحفر ويستخدم هذا النظام في الأعمال البسيطة والخفيفة وعلى الأراضي الصلبة.
2- نظام الحفر بالطرق الميكانيكية، حيث يتم استخدام معدات الحفر الميكانيكية مثل الحفارات والمثقاب الدوار والكسارات الهيدروليكية.
3- نظام الحفر بالحفارات الهيدروليكية، وهو أحد أكثر أنظمة الإنتاج استخدامًا في الحفر العميق والصلب.
4- نظام الحفر بالحفارات الرطبة، حيث يتم استخدام الماء لتبريد الحفرة والمثقاب وللتحكم في الغبار.
5- نظام الحفر بالحفارات الجافة، والذي يستخدم للحفر في المناطق ذات البيئة الجافة والقاسية.
6- نظام الحفر بالتفجير، وهو يعتمد على استخدام المتفجرات لتكسير وتحطيم الصخور في المناطق الحجرية قبل الحفر.