تتضمن أفضل الطرق في إدارة المصانع الخضراء ما يلي:
1- استخدام مصادر الطاقة المتجددة مثل الطاقة الشمسية والرياح والمياه.
2- تحديث نظام إنتاج المصنع بتقنيات أكثر كفاءة وأقل استهلاكًا للموارد.
3- تطوير خطط للحفاظ على المصنع والمواد الخضراء التي يمكن استخدامها في الإنتاج.
4- المحافظة على العمالة وتدريبهم على الإجراءات الخضراء والتحسينات البيئية كما يسعى لخفض المخلفات الناجمة عن الإنتاج.
5- اعتماد استراتيجيات الصيانة والتشغيل الثابتة والتخلص عن المواد الضارة بشكل صحيح.