تعتمد أفضل أدوات الرسم لتصميم الشخصيات الأنيمي على تفضيلات المصمم والمستوى الفني لديه، ولكن هناك بعض الأدوات التي يستخدمها المصممون بشكل شائع وتعتبر من الأفضل لتصميم الشخصيات الأنيمي وهي:
1- Adobe Photoshop: يعتبر من أشهر البرامج المستخدمة في تصميم الشخصيات الأنيمي ويتميز بإمكانية تعديل وتحرير الصور بشكل دقيق.
2- Clip Studio Paint: يعتبر من البرامج الشهيرة في اليابان ويتميز بمجموعة من الأدوات الخاصة بتصميم الشخصيات الأنيمي.
3- Paint Tool SAI: يتميز بواجهة سهلة الاستخدام وبأدوات رسم متنوعة ومميزة.
4- Procreate: يعتبر من البرامج الشهيرة في تصميم الشخصيات الأنيمي لأجهزة الآيباد ويتميز بواجهة سهلة الاستخدام وأدوات رسم متقدمة.
5- Krita: يتميز بأدوات رسم متعددة ومجاني بالكامل، ويدعم أنظمة التشغيل المختلفة مثل ويندوز وماك ولينكس.