تحليل البيانات في الكيمياء الحيوية يعتمد على مجموعة من الأسس والتقنيات، ومن أهمها:
1- برمجة الحاسوب: حيث يستخدم المحللون الحاسوب والبرمجيات الحاسوبية لتحليل البيانات الكيميائية وتفسيرها.
2- التحليل الإحصائي: حيث يستخدم المحللون الإحصاء والتحليل الإحصائي لتقييم البيانات واستنتاج النتائج.
3- فهم عمل الأدوات والتقنيات : حيث يجب على المحللين في الكيمياء الحيوية فهم عمل الأدوات والتقنيات المستخدمة لتوليد البيانات والاستنتاجات المستخرجة منها.
4- علم البيانات: حيث يستخدم المحللون في الكيمياء الحيوية التقنيات المتطورة في مجال البيانات مثل تعلم الآلة وتحليل الصور والتوقعات لتحليل البيانات.
5- حساب المساحات النوعية: فهذا يساعد على تحليل الكميات المراد تحليلها وتحديد النوعية.
6- استخدام النماذج الرياضية: حيث يعتمد على استخدام النماذج الرياضية الخاصة لتحليل بيانات الكيمياء الحيوية وتحديد توقعات النتائج المحتملة.