تكاثر الأحياء البحرية العميقة يختلف عن تكاثر الأحياء السطحية، حيث تكون آليات التكاثر أكثر تخصصًا وتكيفًا للحياة في أعماق المحيطات الداكنة. ومن بين أشهر أساليب تكاثر الأحياء العميقة:
1. الاخصاب الخارجي: حيث يتم إطلاق الأعشاب الذكرية والأنثوية في الماء ، ومن ثم يتم التخصيب من قبل الجامحات الذكرية التي تحوم حولها.
2. الاخصاب الداخلي: يتم إدخال الحيوان المنوي داخل جسم الأنثى بوصلة تزاوج خاصة.
3. النموذج الذكوري: أحد الأشكال الخاصة من الأجناس، وهو ينتج “جلد الحورية” وهو الجنين ولكنه غير مكتمل النمو إذ يسبح في البحر الذي يقل درجة حرارته عن حرارة جسم الأم بحيث يستحيل عليه التطور كجنين داخل أحشاء الأم.
4. التكاثر البوجتية (المنبسط): حيث يتكاثر الأحياء العميقة المبسطة عن طريق الانشطار البوجتي (من شكل تكاثر الاحياء الأولية).
5. الارتجاع الجنسي المتناغم: وهو نوع من التكاثر عن طريق الانقسام الجنسي، يستخدم فيه الحيوانات البحرية العميقة أعضاء خاصة لخلق موجات صوتية تتفاعل مع بعضها البعض عن بعد، ليعمل هذا الصوت على تحفيز جزء آخر من الحيوان الجنسي وتحفيزه على الانقسام الجنسي لتأسيس حياة جديدة.