هناك عدة أساليب يمكن استخدامها لتحسين درجة النقاء للبروتينات، ومنها:
1- التنقية بالكروماتوغرافيا: حيث تستخدم تقنيات الكروماتوغرافيا المختلفة لتحسين نقاء البروتين.
2- الغسل بالمحاليل المناسبة: تستخدم محاليل الغسل المناسبة لإزالة المواد الغير مرغوبة والشوائب.
3- الترشيح: تستخدم تقنيات الترشيح المختلفة لإزالة الجسيمات غير المرغوبة والرواسب.
4- الفصل بالترشيح بالغشاء: يمكن استخدام تقنية الترشيح بالغشاء للفصل بين البروتينات ومكونات الخلية الأخرى.
5- المعالجة بالحرارة: يمكن استخدام المعالجة بالحرارة لتحسين نقاء البروتينات.
6- الحجم الحصري للبروتينات: يتم تحديد الحجم الحصري للبروتينات باستخدام تقنيات الفصل والتنقية المختلفة.
7- التخمير: يستخدم التخمير لتفعيل البروتين وتحسين نقائه.